Прошло всего несколько лет с тех пор, как дьявольские Десептиконы разрушили Чикаго, а потрясающие Автоботы наконец-то дали им отпор. Но, откровенно говоря, человеческая память коротка. И мы, как правило, просто хотим покончить со всеми этими гигантскими роботами-перевертышами. Как хороших, так и плохих. На самом деле, видный правительственный чиновник по имени Гарольд Аттингер уже заявил, что "эра трансформеров закончилась". Поэтому он посылает специальную военную команду "черных оперативников", чтобы выследить всех выживших ботов и избавиться от них навсегда. По крайней мере, такова официальная история. За кулисами происходят серьезные беспринципные вещи. Технологический магнат Джошуа Джойс и его могущественная военно-техническая компания KSI дали Аттингеру семизначные обещания в обмен на разрешение начать эксперименты с трансформирующимися металлами (так называемый трансформиум). Из этого легко податливого материала и остатков десептиконов и автоботов Джойс строит всевозможные планы по созданию роботов. Есть даже инопланетный бот-охотник за головами из новой металломорфной смеси. Назвавшись Локдауном, он предлагает Аттингеру нечто под названием "семя" - устройство, похожее на бомбу, которое является ключом к сбору трансформиума в большем количестве, чем Аттингер и Джойс смогут использовать за столетие. И все, чего хочет в обмен эта мощная груда металла и безумия, — это заполучить в свои руки лидера автоботов по имени... как там его? Ах, да. Оптимус Прайм.