Марлин и Корал молоды и влюблены. Они только что переехали в новый район, нашли идеальный дом и с нетерпением ждут рождения своего первого ребенка. Пусть будет ребенок. Сотни детей. Жизнь молодой пары прекрасна. Но потом все меняется. Свирепый нападающий убивает Корал и пожирает ее потомство, оставляя после себя испуганного Марлина и единственное крошечное яйцо. Вы ведь знали, что Марлин не человек? Он рыба-клоун. Но он не смеется. Прижимая к жабрам свое единственное оставшееся потомство, он погружается в глубину, оплакивая жену и детей. Медленно проходят мрачные дни и страшные ночи. Одинокое яйцо вылупилось, и маленький малыш - рыба-клоун по имени Немо - вырастает в маленького мальчика-клоуна, готового к поступлению в рыбную школу. Но Марлин не очень-то рад отпускать Немо в большое синее море. "Там опасно", - неоднократно повторяет он мальчику. Но время идет вперед, хочешь ты этого или нет. И однажды Марлин сдается и берет Немо в школу. Жизнь налаживается. А потом все снова заканчивается. Бесцеремонно похищенный из школы аквалангистом, Немо оказывается в аквариуме в кабинете дантиста в Сиднее, Австралия. Опустошенный, Марлин ищет своего мальчика в семи морях, сталкиваясь по пути со всевозможными ужасами (акулами, медузами, бушующими течениями, взрывающимися минами).