Действие фильма начинается в Сан-Франциско в 2014 году. После произошедшей там смертельной битвы Марк и Эмма Рассел потеряли своего старшего сына Эндрю, а их маленькая дочь Мэдисон осталась жива. Эмма смотрит вверх и мельком видит самого Годзиллу, где-то после его битвы с MUTOS. В настоящем Марк и Эмма живут отдельно, и она работает палеобиологом в компании Monarch, живя с Мэдисон. Она работает над устройством под названием "Косатка", которое может создавать частоты, используемые для общения с Титанами. Марк по-прежнему пытается поддерживать с ними контакт ради Мэдисон. Позже Эмма и Мэдисон отправляются на подземный объект в Китае, где другие ученые наблюдают за рождением Мотры. Когда она выходит на поверхность, она видит солдат с оружием наготове, и она бурно реагирует, стреляя в них паутиной. Эмма бежит, чтобы попытаться активировать Косатку, и ей удается найти частоту, которую Мотра может понять, что успокаивает ее. Мэдисон даже удается подойти к ней и дотронуться до нее. К несчастью, этот момент прерывается, когда группа экотеррористов под предводительством Алана Джона приходит, убивает оставшихся ученых и похищает Эмму и Мэдисон. Мотре удается сбежать. На слушаниях в сенате по делу Монарха доктор Иширо Серизава, доктор Вивьен Грэм и доктор Сэм Коулман уходят после того, как сенаторы требуют, чтобы Монарх был интегрирован в правительство США.